Evrimsel Genetik
ÖNCEKİ DENEYİM
Doktora Sonrası Araştırmacı
2011-2013
Rasmus Nielsen Laboratuvarı, Kaliforniya Üniversitesi, Berkeley, Kaliforniya, ABD
Doktora Sonrası Araştırmacı
2008-2011
Philipp Khaitovich Laboratuvarı, Hesaplamalı Biyoloji için CAS-MPG Ortak Enstitüsü (PICB), Şanghay, Çin Halk Cumhuriyeti
EĞİTİM
Ph.D
2004-2008
Yaşam Bilimleri Fakültesi, Leipzig Üniversitesi / Max Planck Evrimsel Antropoloji Enstitüsü, Leipzig, Almanya
M.Sc
2001-2003
Biyoteknoloji Bölümü, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara, Türkiye
B.Sc
1996-2001
Biyolojik Bilimler Bölümü, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara, Türkiye
ARAŞTIRMA ÖZETİ
Laboratuvarımız insanlığın yakın tarihi ve evrimi hakkında soruları genom verisi kullanarak cevaplamayı amaçlamaktadır. Bu çalışmalarda insan ve evcil hayvan türlerinde antik DNA (arkeogenom) analizi ve modern popülasyonlara ait popülasyon genomiği analizleri kullanıyoruz. Grubumuz ODTÜ/Hacettepe Arkeogenomik Laboratuvarı'nın parçası olarak çalışmaktadır. Aynı zamanda grubumuz karşılaştırmalı genom ve transkriptom verisi kullanarak iki konu hakkında araştırma yürütmektedir: evrim ve yaşlanma. Bu kapsamdaki geçmiş çalışmalarımız beyin yaşlanmasının moleküler mekanizmaları, yaşlanmanın evrimsel ve moleküler dinamikleri, ayrıca primatlardan balıklara farklı organizmalarda adaptif ve adaptif olmayan evrimsel süreçlerin araştırılmasını içermiştir.
SEÇİLMİŞ YAYINLAR
Turan ZG, Parvizi P, Dönertaş HM, Tung J, Khaitovich P, Somel M. Molecular footprint of Medawar's mutation accumulation process in mammalian aging. Aging Cell. 2019 Aug;18(4):e12965. doi: 10.1111/acel.12965
Kılınç GM, Koptekin D, Atakuman Ç, Sümer AP, Dönertaş HM, Yaka R, Bilgin CC, Büyükkarakaya AM, Baird D, Altınışık E, Flegontov P, Götherström A, Togan İ, Somel M. Archaeogenomic analysis of the first steps of Neolithization in Anatolia and the Aegean. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 2017 Nov 29;284(1867). pii: 20172064. doi: 10.1098/rspb.2017.2064
Dönertaş HM, İzgi H, Kamacıoğlu A, He Z, Khaitovich P, Somel M. Gene expression reversal toward pre-adult levels in the aging human brain and age-related loss of cellular identity. Scientific Reports. 2017 Jul 19;7(1):5894. doi: 10.1038/s41598-017-05927-4
Kılınç GM, Omrak A, Özer F, Günther T, Büyükkarakaya AM, Bıçakçı E, Baird D, Dönertaş HM, Ghalichi A, Yaka R, Koptekin D, Açan SC, Parvizi P, Krzewińska M, Daskalaki EA, Yüncü E, Dağtaş ND, Fairbairn A, Pearson J, Mustafaoğlu G, Erdal YS, Çakan YG, Togan İ, Somel M, Storå J, Jakobsson M, Götherström A. The Demographic Development of the First Farmers in Anatolia. Current Biology. 2016 Oct 10;26(19):2659-2666. doi: 10.1016/j.cub.2016.07.057
Somel M, Liu X, Khaitovich P. Human brain evolution: transcripts, metabolites and their regulators. Nature Reviews Neuroscience. 2013 Feb;14(2):112-27. doi: 10.1038/nrn3372. Epub 2013 Jan 17. Review