EĞİTİM
Ph.D
2005-2011
Biyolojik Kimya ve Moleküler Farmakoloji Bölümü, Harvard Üniversitesi, Cambridge, Massachusetts, ABD
B.Sc
2001-2005
Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Bilkent Üniversitesi, Ankara, Türkiye
ARAŞTIRMA ÖZETİ
Kromatinin hücre kader kararları üzerindeki rolünü araştırıyoruz. Embriyonik gelişim sürecinde, zigot bölünüp farklılaşarak embriyoyu oluşturur. Gelişim safhalarındaki gen ifade değişiklikleri hem konumsal hem de zamansal olarak hassas bir şekilde kontrol edilir. Bir genin kromatin coğrafyası o genin aktivitesi ve açıklığını etkiler. Embriyonik kök hücre farklılaşmasını hücre kader değişimlerinin in vitro modeli olarak kullandığımız laboratuvarımızda, kromatinin gen ifadesini nasıl kontrol ettiğini çalışıyoruz. Moleküler, transkriptomik ve proteomik yaklaşımlarla önemli gen ifade yolak ve mekanizmalarını aydınlatmayı amaçlıyoruz. Ayrıca, laboratuvar çalışmalarımızı destekleyecek şekilde, yüksek çıktılı verilerimizin analizini ve birbiriyle ilişkilendirilmesini sağlamak amacıyla biyoinformatik yaklaşımları benimsiyoruz.
SEÇİLMİŞ YAYINLAR
Keskin EG, Huang J, Terzi Çizmecioğlu N. (2021). Arid4b physically interacts with Tfap2c in mouse embryonic stem cells. Turk J Biol. 45(2):162-170. doi: 10.3906/biy-2010-67. PMID: 33907498.
Guven G, Terzi Çizmecioğlu N. (2021). Arid4b alters cell cycle and cell death dynamics during mouse embryonic stem cell differentiation. Turk J Biol. 45(1):56-64. doi: 10.3906/biy-2009-6 PMID: 33597822.
Terzi Cizmecioglu N, Huang J, Keskin EG, Wang X, Esen I, Chen F, Orkin SH. (2020). ARID4B is critical for mouse embryonic stem cell differentiation towards mesoderm and endoderm, linking epigenetics to pluripotency exit. J Biol Chem. 295(51):17738-17751. doi: 10.1074/jbc.RA120.015534. PMID: 33454011.
Church VA, Pressman S, Isaji M, Truscott M, Cizmecioglu NT, Buratowski S, Frolov MV, Carthew RW (2017). Microprocessor Recruitment to Elongating RNA Polymerase II Is Required for Differential Expression of MicroRNAs. Cell Rep 20 (13), 3123-3134.
Terzi, N., Churchman, L. S., Vasiljeva, L., Weissman, J., and Buratowski, S. (2011). H3K4 trimethylation by Set1 promotes efficient termination by the Nrd1-Nab3-Sen1 pathway. Mol Cell Biol 17, 3569-83.
