Nihal Terzi Çizmecioğlu
Doktor Öğretim Üyesi
      

ARAŞTIRMA ALANI
Gen İfadesinin Regülasyonu

İLETİŞİM BİLGİLERİ

+90 (312) 210 5181
Ofis 244

ODTÜ AVESİS Profili  
ÖNCEKİ DENEYİM

Doktora Sonrası Araştırmacı

2011-2016

Hematoloji/Onkoloji Bölümü, Boston Çocuk Hastanesi, Boston, Massachusetts, ABD

EĞİTİM

Ph.D

2005-2011

Biyolojik Kimya ve Moleküler Farmakoloji Bölümü, Harvard Üniversitesi, Cambridge, Massachusetts, ABD

B.Sc

2001-2005

Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Bilkent Üniversitesi, Ankara, Türkiye

ARAŞTIRMA ÖZETİ

Kromatinin hücre kader kararları üzerindeki rolünü araştırıyoruz. Embriyonik gelişim sürecinde, zigot bölünüp farklılaşarak embriyoyu oluşturur. Gelişim safhalarındaki gen ifade değişiklikleri hem konumsal hem de zamansal olarak hassas bir şekilde kontrol edilir. Bir genin kromatin coğrafyası o genin aktivitesi ve açıklığını etkiler. Embriyonik kök hücre farklılaşmasını hücre kader değişimlerinin in vitro modeli olarak kullandığımız laboratuvarımızda, kromatinin gen ifadesini nasıl kontrol ettiğini çalışıyoruz. Moleküler, transkriptomik ve proteomik yaklaşımlarla önemli gen ifade yolak ve mekanizmalarını aydınlatmayı amaçlıyoruz. Ayrıca, laboratuvar çalışmalarımızı destekleyecek şekilde, yüksek çıktılı verilerimizin analizini ve birbiriyle ilişkilendirilmesini sağlamak amacıyla biyoinformatik yaklaşımları benimsiyoruz.


SEÇİLMİŞ YAYINLAR

Keskin EG, Huang J, Terzi Çizmecioğlu N. (2021). Arid4b physically interacts with Tfap2c in mouse embryonic stem cells. Turk J Biol. 45(2):162-170. doi: 10.3906/biy-2010-67. PMID: 33907498.


Guven G, Terzi Çizmecioğlu N. (2021). Arid4b alters cell cycle and cell death dynamics during mouse embryonic stem cell differentiation. Turk J Biol. 45(1):56-64. doi: 10.3906/biy-2009-6 PMID: 33597822.


Terzi Cizmecioglu N, Huang J, Keskin EG, Wang X, Esen I, Chen F, Orkin SH. (2020). ARID4B is critical for mouse embryonic stem cell differentiation towards mesoderm and endoderm, linking epigenetics to pluripotency exit. J Biol Chem. 295(51):17738-17751. doi: 10.1074/jbc.RA120.015534. PMID: 33454011.


Church VA, Pressman S, Isaji M, Truscott M, Cizmecioglu NT, Buratowski S, Frolov MV, Carthew RW (2017). Microprocessor Recruitment to Elongating RNA Polymerase II Is Required for Differential Expression of MicroRNAs. Cell Rep 20 (13), 3123-3134.


Terzi, N., Churchman, L. S., Vasiljeva, L., Weissman, J., and Buratowski, S. (2011). H3K4 trimethylation by Set1 promotes efficient termination by the Nrd1-Nab3-Sen1 pathway. Mol Cell Biol 17, 3569-83.

SON YAYINLAR


Nihal Terzi Çizmecioğlu'nun tüm yayınlarının listesine ulaşmak için lütfen buraya tıklayın.


Son Güncelleme:
01/18/2024 - 21:39